تم تصنيف جامعة تونس المنار ضمن أفضل 400 جامعة في العالم حسب ما نشر التصنيف الدولي التايمز للتعليم العالي "THE Impact Ranking" في تقريره السنوي بخصوص الجامعات المؤثرة في محيطها حول العالم لسنة 2020.
كما صنفت جامعة تونس المنار ضمن أفضل 200 مؤسسة جامعية في مجالات التعليم والصحة وكذلك ضمن أفضل 300 مؤسسة جامعية حسب مؤشري"السلام والعدالة والمؤسسات" و"الشراكة من أجل هدف التنمية المستدامة"
وخلال سنتي 2018 و2019 صنفت جامعة تونس المنار ضمن قائمة 801-900 لأفضل الجامعات على المستوى العالمي حسب تصنيف شانغهاي الدولي للجامعات حيث برزت ضمن قائمة أفضل 500 مؤسسة جامعية في اختصاصي "الطب السريري" والبيوتكنولوجيا" .كما كانت الجامعة المغاربية الوحيدة ضمن تصنيف شانغهاي لسنة 2019.
وفي تصنيف التايمز للتعليم العالي "Times Higher Education (THE)"صنفت جامعة تونس المنار:
- خلال سنة 2019 ضمن أفضل 300 جامعة على مستوى العالم وفي قائمة الجامعات الفتية "The Young Universities" وفي قائمة الجامعات المؤثرة على محيطها "The University impact".
- وخلال سنة 2018 ضمن أفضل 300 جامعة في ترتيب جامعات الدول الناشئة المعروف بتصنيف النجوم الصاعدة "Etoiles montantes"
